Tomteboda nedre var från början (1876) en förbindelspunkt mellan stambanan och Västeråsbanan, från 1878 även hållplats och från 1890 fullständig station. Omkring 1917 bröts förbindelsepunkten ut till Tomteboda övre fp medan återstoden av Tomteboda nedre blev Tomteboda. Persontrafiken nedlades 1929.
Det gamla stationshuset togs i bruk för annat ändamål och efter att ca 15 år ha varit inhyst i den f.d. ställverksbyggnaden flyttade tågexpeditionen in i en nyuppförd byggnad i maj 1942. Den inrymde även lokaler för bangårdspersonalen m.m. (beskrivning i Statsbaneingenjören mars 1943).
Det gamla stationshuset förklarades som byggnadsminne, men revs ändock i juli 2006. 1942 års stationshus är också rivet, vilket lär ha skett något av de tio första åren på 2000-talet.